SYNTHESIS AND MOLECULAR DOCKING ON IONIC LIQUIDS

Abstract

This study explores the molecular docking potential of a newly synthesized ionic liquid (IL) using Auto Dock Vina to assess its binding interactions with [DHPS protein ]. The IL, prepared by Dr CHAKER . Computational docking simulations against revealed strong binding affinities (ΔG =-7 kcal/mol), driven by hydrogen bonding, hydrophobic interactions, and ionic contacts. Comparative analysis with reference ligands highlighted the IL’s superior binding stability and selectivity, attributed to its unique cationic/anionic architecture. Promisingly, the IL exhibited low toxicity in silico (via ADMET prediction) and enhanced biodegradability, positioning it as a sustainable candidate for various applications. These results underscore its potential for and warrant further experimental validation. This work bridges synthetic chemistry and computational biology, offering insights into designing functional ionic liquids for biomedical or industrial applications .

Cette étude explore le potentiel de docking moléculaire d'un liquide ionique (IL) nouvellement synthétisé en utilisant Auto Dock Vina pour évaluer ses interactions de liaison avec la protéine [DHPS]. L'IL, préparé par le Dr CHAKER. Les simulations de docking computationnel contre ont révélé de fortes affinités de liaison (ΔG =-7 kcal/mol), motivées par des liaisons hydrogène, des interactions hydrophobes et des contacts ioniques. L'analyse comparative avec des ligands de référence a mis en évidence la stabilité et la sélectivité supérieures de liaison de l'IL, attribuées à son architecture cationique/anionique unique. Prometteusement, le IL a montré une faible toxicité in silico (via la prédiction ADMET) et une biodégradabilité améliorée, le positionnant comme un candidat durable pour diverses applications. Ces résultats soulignent son potentiel et justifient une validation expérimentale supplémentaire. Ce travail fait le lien entre la chimie synthétique et la biologie computationnelle, offrant des perspectives sur la conception de liquides ioniques fonctionnels pour des applications biomédicales ou industrielles.